Antecedentes: El diagnóstico rápido de las infecciones por micobacterias es esencial para comenzar con una adecuada terapia antimicrobiana y realizar un control efectivo de la enfermedad. Objetivo: Evaluar el rendimiento del  sistema automatizado  Bact/ALERT 3D para el aislamiento de micobacterias y compararlo con el medio de cultivo Löwenstein–Jensen (L-J).
Materiales y métodos: Se analizaron 196 muestras pulmonares y extrapulmonares, recibidas en LNRTBL, enero-diciembre 2013. Las muestras se inocularon simultáneamente  en LJ y Bact/ALERT 3D. Se calcularon los indicadores de desempeño del sistema automatizado.
Resultados: Mycobacterium tuberculosis se  identificó en 36 muestras; 16 por LJ y 20  por el Bact/ALERT 3D; solo se identificó una cepa de micobacteria no tuberculosa se ien una sola muestra por ambos métodos. El tiempo de detección de crecimiento para Bact/ALERT 3D fue 16,5 días, significativamente menor que el obtenido por L-J (37.2 días). Los valores de sensibilidad, especificidad, índice de validez e índice de Youden fueron de 100%, 97.9%, 98.1% y 0.98, respectivamente. La  tasa de contaminación por el LJ 4.1% y Bact/ ALERT 3D  fue de 7.6%, respectivamente.
Conclusiones: El sistema Bact/ALERT 3D debe de utilizarse en combinación con el cultivo en L-J para asegurar el aislamiento de micobacterias. Disminuyó significativamente el tiempo de diagnóstico de las micobacterias al tener un tiempo de detección de crecimiento significativamente menor que el L-J, lo que permitió iniciar el tratamiento específico a los pacientes, en particular  a los enfermos con TB pulmonar negativos a la baciloscopía.